פרופ' פורת מכהן כיום כמנהל מחלקה פנימית בבית החולים סורוקה וכראש המחלקה למדיניות רפואית בשירותי בריאות כללית. במקביל, מוביל פרופ' פורת את תכנית המדדים הלאומית הבוחנת את הביצועים הרפואיים של קופות החולים. פרופ' פורת יזם והיה ממייסדי החברה לאיכות ברפואה מטעם ההסתדרות הרפואית וכיהן שנים רבות כיו"ר החברה. פרופ' פורת הוא נציג ישראל בוועדת האיחוד האירופי לרפואה הפנימית.
פרופ' פורת משלב בתפקידיו המגוונים גם הוראה ומחקר, והרבה לפרסם מאמרים בתחומים שונים.
בתפקידו החדש, יישא פרופ' פורת באחריות לקביעת המדיניות הרפואית של מכבי שירותי בריאות, המשרתת למעלה ממיליון ושמונה מאות אלף אזרחים, ולהוצאתה לפועל. מנכ"ל מכבי, ד"ר אהוד קוקיה הציב שלשה יעדים מרכזיים בפני מכבי והם: קידום השוויון ברפואה, הצבת החבר וצרכיו במרכז הפעילות וצמיחה במספר חברי מכבי. חטיבת הבריאות במכבי היא השותפה המרכזית והעיקרית בהשגת יעדים אלה בהיותה אחראית על כל שירותי הרפואה של הקופה, על הקשר עם הרופאים והמטפלים הפרא-רפואיים ועוד.
פרופ' אבי פורת מסר כי: "מכבי היא ללא ספק ארגון מוביל ומוערך במערכת הבריאות בישראל ואני מודה על הזכות שניתנה לי לטול חלק מרכזי בעשייה הרפואית של ארגון החשוב הזה. אני עוזב את שירותי בריאות כללית ואת סורוקה לטובת אתגרים חדשים, אך אין ספק כי אקח עימי למכבי הרבה מאד דברים טובים שלמדתי כאן. זו ההזדמנות שלי להודות לעמיתים ושותפים לדרך בתפקידים השונים על שנים של עבודה משותפת, שהביאה מזור ומרפא למטופלים רבים, וקידמה את איכות הטיפול בתחומים רבים וחשובים".
ד"ר אהוד קוקיה, מנכ"ל מכבי שירותי בריאות הוסיף "פרופ' פורת הוא ללא ספק אחד מן הגורמים הבכירים ביותר במערכת הבריאות בישראל והוא אף צבר לעצמו יוקרה גם ברמה הבין לאומית. הצטרפותו למכבי מחזקת אותנו ומוסיפה לנו ניסיון רב שנים בשילוב רפואה ומינהל. אופייה של מערכת הבריאות ושל מכבי יכתיבו לפרופ' פורת התאקלמות מהירה וכמעט מיידית, וכבר עם כניסתו לתפקיד יהיה עליו להתמודד עם משמעויות תחלואת החורף, מבצע חיסוני השפעת ועוד. מגיעה תודה גדולה והוקרה לד"ר חגי קדם ולד"ר נפתלי שני שחילקו ביניהם עד עתה את תפקידי ראש חטיבת הבריאות ואני משוכנע כי הם יהיו גם בעתיד הגורם המרכזי והמניע למהלכים רבים בתוך החטיבה."